К 1999 году работающий прототип Google Search уже был написан. Я им лично пользовался.
Просто код нужно было масштабировать и пригладить.
PhD были нужны потому, что основателям Гугла было с ними легче работать - привычная среда.

Любые seed money могут быть полезны для стартапа. Не только от CIA.

Сами по себе CIA в новых разработках как-то не очень - слишком уж много бюрократии.